-
?Stigmatogobius amblystoma Zander, 1972
-
Stigmatogobius borneensis Koumans, 1953
- Gobius borneensis Bleeker, 1851; (valid as)
-
Stigmatogobius brocki Roberts, 1989
- Vaimosa brocki Herre, 1936; (valid as)
-
Stigmatogobius hoevenii Talwar & Jhingran, 1991
- Gobius hoevenii Bleeker, 1851; (valid as)
-
Stigmatogobius javanicus
- Gobius javanicus Bleeker, 1856; (valid as)
- Gobius melanosticta Day, 1876; (synonym)
- Gobius chilkensis Jenkins, 1910; (synonym)
- Pseudogobius javanicus Koumans (ex Bleeker), 1931; (valid as)
- Pseudogobius javanicus Aurich, 1938; (valid as)
- Stigmatogobius micrognathus Visweswara Rao, 1971; (synonym)
- Pseudogobius javanicus Prince Akihito, 1984; (valid as)
- Stigmatogobius javanicus Talwar & Jhingran, 1991; (valid as)
- Pseudogobius javanicus; [CoL]
-
Stigmatogobius johnstoniensis
- Gobius johnstoniensis Koumans (ex De Vis), 1940; (unavailable, in synonymy)
- ?Gobius johnstoniensis Whitley, 1952
-
Stigmatogobius minima Talwar & Jhingran, 1991
- Ctenogobius minima Hora, 1923; (valid as)
- Stigmatogobius yanamensis Visweswara Rao, 1971; (synonym)
- Stigmatogobius minima; [CoL]
-
?Stigmatogobius minutus Takagi, 1957
-
Stigmatogobius pleurostigma
- Gobius pleurostigma Bleeker, 1849; (valid as)
- Stigmatogobius pleurostigma Bleeker, 1874; (valid as)
-
Stigmatogobius sadanundio Talwar & Jhingran, 1991
- Gobius sadanundio Hamilton, 1822; (valid as)
-
?Stigmatogobius singapurensis Bleeker, 1878